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新聞動態(tài)

堿裂解法提取質(zhì)粒DNA的原理、方法及各試劑的作用

實(shí)驗(yàn)原理

堿裂解法提取質(zhì)粒DNA,是利用共價閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA與線性的染色體DNA片段在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們。在堿性環(huán)境中,細(xì)菌染色體DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)解開變性,而質(zhì)粒DNA的氫鍵雖斷裂,但兩條互補(bǔ)鏈仍相互盤繞處于結(jié)合纏繞狀態(tài)。將溶液的pH調(diào)至中性并在高鹽存在的條件下,染色體DNA、大分子量的RNA和蛋白質(zhì)在SDS(十二烷基硫酸鈉)的作用下形成沉淀,而質(zhì)粒DNA仍然為可溶狀態(tài)。通過離心,可除去大部分細(xì)胞碎片、染色體DNA、RNA及蛋白質(zhì),而質(zhì)粒DNA留在上清液中,通過酚/氯仿抽提純化得到質(zhì)粒DNA。

實(shí)驗(yàn)器材

恒溫培養(yǎng)箱臺式恒溫?fù)u床、高壓滅菌鍋、超凈工作臺、高速離心機(jī)、移液器、移液器吸頭、三角瓶、1.5ml離心管、離心管架、帶有pUC19質(zhì)粒的大腸桿菌等。

實(shí)驗(yàn)試劑

(1)無水乙醇。

(2)LB培養(yǎng)基(1L):稱量胰蛋白胨10.0g,酵母粉5.0g,氯化鈉5.0g溶于800ml蒸餾水中,用1mol/L氫氧化鈉溶液(或1mol/L鹽酸溶液)調(diào)節(jié)pH至7.0,然后加蒸餾水至1000ml,高溫高壓滅菌后備用。

(3)質(zhì)粒小提試劑盒(離心柱型),試劑盒的產(chǎn)品組成如下:

1)平衡液BL。

2)溶液P1:50mmol/L葡萄糖,25mmol/L Tris-Cl(pH8.0),10mmol/L EDTA(pH8.0)。

3)溶液P2:0.2mol/L NaOH,1%SDS。

4)溶液P3:稱取29.4g乙酸鉀和11.5ml冰乙酸混合,加H2O至100ml。

5)去蛋白液PD。

6)漂洗液PW。

7)洗脫緩沖液EB。

8)RNase A。

9)吸附柱CP3。

10)2ml收集管。

實(shí)驗(yàn)操作

(1)接一環(huán)新鮮菌體于5ml含有適當(dāng)抗生素的液體培養(yǎng)基中,37℃搖床(200rpm)過夜培養(yǎng)。

(2)柱平衡步驟:向吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中)加入500μl的平衡液BL,12000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CP3重新放回收集管中。

(3)將1.5ml過夜培養(yǎng)菌液放于離心管中,12000rpm離心1min,棄去上清液,收集菌體。

(4)向留有菌體沉淀的離心管中加入250μl溶液P1,使用移液器吹打徹底懸浮菌體沉淀,使菌體懸浮均勻。

(5)向離心管中加入250μl溶液P2,溫和地上下翻轉(zhuǎn)6~8次,使菌體充分裂解,菌液變得清亮黏稠。

(6)向離心管中加入350μl溶液P3,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn)6~8次,充分混勻,此時會出現(xiàn)白色絮狀沉淀。12000rpm離心10min。

(7)用移液器吸出步驟(6)收集的上清液,轉(zhuǎn)移到吸附柱CP3中,注意盡量不要吸出沉淀,12000rpm離心10min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CP3重新放回收集管中。

(8)向吸附柱CP3中加入500μl漂洗液PW,12000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CP3放入收集管中。

(9)重復(fù)操作步驟(8)。

(10)將吸附柱CP3放入收集管中,12000rpm離心2min,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除。

(11)將吸附柱CP3置于一個干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位滴加50~100μl洗脫緩沖液EB,室溫放置2min,12000rpm離心2min,將質(zhì)粒溶液收集到離心管中。

注意事項

(1)溶液P1在使用前先檢查是否已加入RNase A,每次實(shí)驗(yàn)結(jié)束后應(yīng)置于2~8℃環(huán)境中保存。

(2)溫度較低時,溶液P2會出現(xiàn)白色沉淀,可在37℃水浴中加熱幾分鐘,搖勻后使用。

(3)注意離心機(jī)的平衡問題,所有離心步驟均為使用常規(guī)臺式離心機(jī)在室溫下進(jìn)行離心。

實(shí)驗(yàn)意義

質(zhì)粒是共價、閉合、環(huán)狀的小分子量DNA,在基因工程中,質(zhì)粒是目的基因的載體。從大腸桿菌中提取質(zhì)粒DNA在分子生物學(xué)上是一種最基本的方法。


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